Moleküle vergleichbarer elektrischer Ladung (z. B. DNA) trennen sich gemäß ihrer Größe auf. In der Molekularbiologie werden Nukleinsäuren durch Gelektrophorese in einer Gelmatrix (Polyacrylamid oder Agarose) aufgetrennt. Aufgrund ihrer negativen Ladung wandern sie ihrer Größe nach mit unterschiedlicher Geschwindigkeit zum Pluspol (Anode).